Так в каноне кроме того абзаца в первой книге вроде как инквизиция не упоминается, этол в фандоме про нее шумят. Но не в каноне.
А магглов маги не любят за другое.
Хотя может просто в чем-то им завидуют?

Добавлено 24.10.2013 - 14:56:
А насчет инквизиции неплохо показано у Гюго в Соборе Парижской Богоматери, когда Клод Фролло решил, что если не может обладать цыганкой Эсмиральдой, тогда пусть страдает, обвинил в покушении на одного типа, а потом и в колдовстве. А она в ходе "допроса" (вроде бы ей и испанский сапожок надевали) она вовсем созналась. Хотя была невиновна.