Если бы чистокровные относились к маглорожденным, как к равным, и причин для страха не было бы. А если тебя в маг.мир. силком затащили(простите, но в добровольность поступления маглорожденных в Хогвартс я не верю), а потом оскорбляют на каждом шагу, то естественно поискать союхников для борьбы с теми, кто тебя унижает. И обычные люди являются таковыми.
Хотя разумеется истинную причину ненависти к маглорожденным озвучил Драко в начале второй книги: как же так, я весь такой из себя аристократишка, а какая-то маглорожденная смеет быть умнее. Мочить ее!!! А все остальное от лукавого.