Мысль интересная, но ни абстрактный "прогресс", ни более конкретные "рациональность" и "оптимизация работы мозга" не являются базовой ценностью для Скайнет. Его создавали для защиты США, а точнее (будем честными), доминирующего положения тех самых врунов из правительства. Приписывать Скайнет другие (не заданные изначальной программой) цели можно, но уже после того, что авторы называют осознанием себя.
Мне лично Ваши рассуждения кажутся продиктованными теми самыми эмоциями, которые по Вашим словам у Скайнет отсутствуют.
Для меня-то, как раз, очевидно, что раз целеполагание биологических систем управляются именно эмоциями, то и возникновение новых целей у систем электронных можно и нужно считать эквивалентным появлению (аналога, вот чего у Скайнет точно нет, так это гормонов) эмоций.