Так министр и вмешивается обходя действующее законодательство своими декретами. Т.е. вместо того, чтобы банально отстранить Дамблдора скажем за неудовлетворительный уровень обучения юных волшебников (что в общем-то было бы вполне обоснованным), он вынужден бороться с ним, используя чрезвычайные полномочия. А директор попросту не мешает Фаджу влезть на табурет, старательно намылить веревку и сунуть голову в петлю. После чего легким движением ноги не только восстанавливает все свое влияние, но и получает дополнительный кредит доверия. Так что скорее всего Альбуса все устраивало, и он попросту позволял идти событиям своим чередом.