В каноне он это, вроде как, допер и это как раз и было одной из причин почему он именно Поттера хотел сцапать (потешить свое ЧСВ и убить врага, все-таки ни разу не на первом месте, не будь нужна именно кровь Поттера, мог бы случайного мага отловить, всяко не столь рискованно).
Но, согласен, там после гибели Квиррела особых сомнений быть не должно. Тут же ему тоже есть над чем поразмыслить:
Дано:
1. Его сразила сразила его же собственная Авада, отразившаяся от ребенка.
2. Он перед этим убил родителей Гарри.
3. Он велел Лили отойти, но после отказа и слов "убейте лучше меня, а не его" - убил (вот только почему, интересно, ожидаемо же, что мать кинется защищать ребенка. В планах-то изначльно было в живых ее оставить...).
4. Пацана мариновали "у магглов". Что не детдом - почти наверняка - живых родственников-магов достаточно - наверняка забрали бы, значит, приемная маггловская семья произволом господина дирктора. А у Лили так удобно сестра имеется (Питер, если что, друг семьи Поттеров. Не мог не знать самого факта существования).
По факту - жертва имела место. И, по крайней мере, подозревать подобное маг с его познаниями должон, даже без канонных ожогов Квиррела. Они лишь должны были превратить серьезное обоснованное подозрение в 100 проц уверенность, не более того.